Предыстория гимназии начинается в 1993 году. Тогда несколько родителей, воодушевленных идеей воспитания своих детей в православной традиции, создают школу «Малая Академия Гармонии». Возглавила школу Давыдова С.Н., духовно окормлял иерей Алексей Тимофеев из Никольской церкви с. Озерецкого. В 1995г., в связи с расширением школы, директор арендует помещения в здании детского сада на Керамзаводе.

В 1997г. Школа реорганизуется в общеобразовательное учреждение «Православная классическая гимназия «Лучица». Директором гимназии становится Петровская Е.В., духовное попечение принимает настоятель храма Архистратига Михаила на Красной Поляне иерей Виктор Саввин.

Многотрудно протекала жизнь «Лучицы». Расположенная в здании, окруженном небольшими болотцами, испытывающая постоянную нужду во всем, гимназия жила ожиданием, что у нее будет свой храм.

Осенью 1997 года пишется прошение об открытии на территории гимназии храма. По благословению благочинного игумена Александра (Агрикова), ныне епископа Дмитровского, создается молитвенная комната, в которой служатся молебны и литии, а окормляет гимназию настоятель Троицкого храма с.Драчева иеромонах Даниил (Жирнов), ныне игумен, благочинный церквей Можайского округа, духовник Московской епархии.

Каждую неделю на богослужении молились об упокоении Царской семьи, с верой, что страстотерпцы будут предстательствовать пред Господом за гимназистов и их родителей. Многотрудная жизнь школы-храма продолжалась: несколько поджогов домового храма, бесчинства по ночам на территории гимназии, стекла школы постоянно разбивались.

В январе 2000 года место «Лучицы» занимает «Православная гимназия во имя святителя Филарета Московского». И в этом же году Приходом Филаретовского храма было получено свидетельство на муниципальное имущество, а в 2007 году свидетельство на землю. Собранием прихожан Филаретовского храма был избран приходской совет и исполняющий обязанности директора гимназии.

В сентябре 2005 года Православную гимназию во имя свт. Филарета Московского посетил архиепископ Можайский Григорий, викарий Московской епархии. Впервые после 1917 года в г. Лобня приехал священнослужитель, имеющий столь высокий духовный сан.

Затем начинается поэтапное восстановление и ремонт старого здания. Для правильного питания детей приводится в порядок блок питания. Многое находилось в непригодном состоянии с большим количеством старой сантехники, с большими глубокими металлическими ёмкостями-раковинами, с очень плохой канализацией. Ежемесячно откачивается вода из подвала и люков силами прихожан и работников Водоканала. Вода была только холодная, свет постоянно отключался. Постепенно налаживается электропроводка. Проводится горячая вода, устанавливаются водомеры. В конечном итоге в 2009 году сделали полный капитальный ремонт кухни: установили новые окна, полы покрыли плиткой, стены – кафелем. Тогда же закупили плиту, холодильник, морозилку, необходимое оборудование и посуду, согласно существующим нормам. Оборудовали приходскую трапезную мебелью и полным убранством.

С помощью Божией, каждое лето, начиная с 2008 года, проводится постоянный ремонт классов гимназии в соответствии с нормами. Улучшается планировка классных комнат, библиотеки, кабинета директора, кабинета врача. Производится ремонт стен, замена полов, установка новых окон. Закупается новая мебель: парты, столы, доски. Был подготовлен музыкальный класс. Здесь дети занимаются музыкой, пением, изобразительным творчеством и рукоделием, для чего настоятель отдал свою келью. Летом 2011 года произвели капитальный ремонт главного предела и притвора Филаретовского храма: стены, потолок, установили окна, парадное крыльцо, выложили плиткой полы. Таким образом, освободятся помещения в здании гимназии для новых классов.
В 2007 году было получено свидетельство на землю. Собранием прихожан Филаретовского храма был избран приходской совет и исполняющий обязанности директора -Мирзоева И.В. В этом же году настоятелем храма и учредителем гимназии стал иерей Димитрий Григорьянц. В 2009 году открылся первый православный детский сад, за что была получена грамота от губернатора Московской области В 200.9 году с Божией помощью, и при участии администрации г. Лобня был построен теннисный корт, где сегодня занимаются физкультурой учащиеся гимназии. Была оформлена игровая площадка с английской лужайкой и беседкой согласно существующим нормам. В 2013 году все деревянные композиции и беседка были заново окрашены.
Часть территории прихода Филаретовского храма (около 1 га земли) вдоль по кирпичной ограде и до здания гимназии регулярно заливалась грунтовыми водами. Долгое время пытались эту территорию засыпать песком, но летом вода была постоянно.

В 2013 году, с помощью Божией, и при содействии благотворителей, полностью произведён дренаж затопленного водой участка, а территория оформлена газоном и зелёными насаждениями.
В 2013 году Православная гимназия получила Свидетельство об аккредитации. В 2014 году на Пасху открывается новая церковная лавка в здании дома причта, что позволяет сделать серьезную перепланировку помещений гимназии.
В 2014 году на Пасху открывается новая церковная лавка в здании дома причта, что позволяет сделать серьезную перепланировку помещений гимназии. В результате ремонта появляются два новых кабинета.
В 2016 году директором гимназии был назначен протоиерей Димитрий Григорьянц.

В 2021 году гимназия получила лицензию на обучение старшеклассников, был набран первый 10 класс.
В 2022 году было получено Конфессиональное представление и Лицензия от Министерства образования Московской области на все виды деятельности гимназии – дошкольное, начальное, основное, среднее и дополнительное образование.
Весной 2023 года на территории гимназии была торжественно открыта новая современная спортивная площадка.
Благодаря посильной помощи родителей и благотворителей приятно замечать, как наша гимназия расцветает с годами!