Многотрудно протекала жизнь «Лучицы». Расположенная в здании, окруженном небольшими болотцами, испытывающая постоянную нужду во всем, гимназия жила ожиданием, что у нее будет свой храм.
Осенью 1997 года пишется прошение об открытии на территории гимназии храма. По благословению благочинного игумена Александра (Агрикова), ныне епископа Дмитровского, создается молитвенная комната, в которой служатся молебны и литии, а окормляет гимназию настоятель Троицкого храма с.Драчева иеромонах Даниил (Жирнов), ныне игумен, благочинный церквей Можайского округа, духовник Московской епархии.
Каждую неделю на богослужении молились об упокоении Царской семьи, с верой, что страстотерпцы будут предстательствовать пред Господом за гимназистов и их родителей. Многотрудная жизнь школы-храма продолжалась: несколько поджогов домового храма, бесчинства по ночам на территории гимназии, стекла школы постоянно разбивались.
В январе 2000 года место «Лучицы» занимает «Православная гимназия во имя святителя Филарета Московского». И в этом же году Приходом Филаретовского храма было получено свидетельство на муниципальное имущество, а в 2007 году свидетельство на землю. Собранием прихожан Филаретовского храма был избран приходской совет и исполняющий обязанности директора гимназии.
В сентябре 2005 года Православную гимназию во имя свт. Филарета Московского посетил архиепископ Можайский Григорий, викарий Московской епархии. Впервые после 1917 года в г. Лобня приехал священнослужитель, имеющий столь высокий духовный сан.
Затем начинается поэтапное восстановление и ремонт старого здания. Для правильного питания детей приводится в порядок блок питания. Многое находилось в непригодном состоянии с большим количеством старой сантехники, с большими глубокими металлическими ёмкостями-раковинами, с очень плохой канализацией. Ежемесячно откачивается вода из подвала и люков силами прихожан и работников Водоканала. Вода была только холодная, свет постоянно отключался. Постепенно налаживается электропроводка. Проводится горячая вода, устанавливаются водомеры. В конечном итоге в 2009 году сделали полный капитальный ремонт кухни: установили новые окна, полы покрыли плиткой, стены – кафелем. Тогда же закупили плиту, холодильник, морозилку, необходимое оборудование и посуду, согласно существующим нормам. Оборудовали приходскую трапезную мебелью и полным убранством.
С помощью Божией, каждое лето, начиная с 2008 года, проводится постоянный ремонт классов гимназии в соответствии с нормами. Улучшается планировка классных комнат, библиотеки, кабинета директора, кабинета врача. Производится ремонт стен, замена полов, установка новых окон. Закупается новая мебель: парты, столы, доски. Был подготовлен музыкальный класс. Здесь дети занимаются музыкой, пением, изобразительным творчеством и рукоделием, для чего настоятель отдал свою келью. Летом 2011 года произвели капитальный ремонт главного предела и притвора Филаретовского храма: стены, потолок, установили окна, парадное крыльцо, выложили плиткой полы. Таким образом, освободятся помещения в здании гимназии для новых классов.